O ISCTEM, como instituição de ensino superior em Moçambique, reconhece que possui uma enorme responsabilidade no sentido de contribuir na produção de novos saberes, úteis, não só para o processo de ensino, mas também que respondam às prioridades de desenvolvimento do país, do continente e do mundo.

O objetivo actual do ISCTEM é desenvolver uma estratégia, através de uma nova plataforma de actividade científica, que irá constituir uma mais valia para a desenvolvimento da base de conhecimentos produzidos, em Moçambique, nas seguintes áreas:

1. Ciências Sociais e Humanas (estudos de desenvolvimento social, reforço da capacidade institucional, estudos ambientais e outros);

2. Ciências Médicas e de Saúde (odontologia, farmácia, homeopatia, produção de medicamentos naturais, e atenção especial à questões essenciais como o VIH/SIDA, saneamento, alimentação e outras áreas)

3. Estudos multidisciplinares para o Desenvolvimento de Moçambique (estudos que irão cruzar múltiplas disciplinas)

4. Ciências de Gestão (liderança, empreendedorismo, gestão, e outros).

O ISCTEM tem, também, como objectivo, a integração das Tecnologias de Informação e Comunicação na sua actividade científica como instrumentos de operacionalização dos processos de pesquisa nas diversas áreas.