O ISCTEM desenvolve as suas acções de ensino em diversas áreas. No nível de graduação, oferece bacharelatos e licenciaturas nas áreas de Administração Pública, Ciências Sociais, Contabilidade e Auditoria, Direito, Engenharia Informática, Farmácia, Gestão de Empresas e Medicina Dentária. No nível de pós-graduação, são oferecidos os cursos de mestrado em Sócio-Economia do Desenvolvimento e Doutoramento em Direito.

Para além dos cursos superiores, o ISCTEM oferece uma formação propedêutica, destinada a preparar todos os alunos que pretendem ingressar nos cursos de graduação oferecidos na Instituição.

No âmbito da melhoria da qualidade de formação, a articulação com outros níveis de ensino e a interacção com a sociedade, O ISCTEM iniciou, em 2003, a leccionação do ensino médio geral, 11ª e 12ª classes, com planos curriculares integrados no Sistema Nacional de Educação e outros orientados para o desenvolvimento de competências específicas.

O ISCTEM possui uma Unidade Politécnica que desenvolve cursos de natureza profissionalizante a vários níveis. Nela está a Academia CISCO que oferece cursos no domínio das redes informáticas nomeadamente, IT Essential, CCNA, Segurança e Wireless. A Unidade Politécnica é também responsável pelo Laboratório de Simulação Empresarial montado para os estudantes dos cursos de licenciatura em Gestão e Contabilidade e Auditoria.

Para além da actividade de ensino, o ISCTEM dispõe de uma Clínica Dentária que tem servido de campo de estágios para os estudantes do curso de Medicina Dentária e oferece serviços ao público em geral.